http://mirian.kisti.re.kr/futuremonitor/view.jsp?cn=GTB2014110903&service_code=03
KISTI ¹Ì¸®¾È ¡º±Û·Î¹úµ¿Çâºê¸®ÇΡ» 2014-11-25
¸î ³â¿¡ °ÉÄ£ ½ÇÇèÁã¿Í À¯ÀüÀÚ Á¶Àý¿¬±¸¸¦ ÇÏ¸é¼ ÀÌ ¿¬±¸ÆÀÀº Àΰ£°ú ½ÇÇèÁã »çÀÌÀÇ À¯»ç¼º°ú Â÷ÀÌÁ¡ÀÌ À¯Àüü¿¡ ¾î¶»°Ô °¢ÀεǾî Àִ°¡¸¦ ÀÌÇØÇϴµ¥ µµ¿òÀ» ÁÙ ¼ö ÀÖ°Ô µÇ¾ú´Ù. À̹ø ¹ß°ßÀº ½ÇÇèÁã À¯Àüü ¿¬±¸ÇÁ·ÎÁ§Æ® ÄÁ¼Ò½Ã¾öÀÎ ENCODE ÄÁ¼Ò½Ã¾öÀÌ ÇмúÁö <³×ÀÌó>¿Í ´Ù¸¥ Àú³Î¿¡ ¹ßÇ¥ÇÑ ³× ÆíÀÇ ³í¹®¿¡¼ ½ÇÇèÁã¿Í Àΰ£ÀÇ À¯Àüü¸¦ Á¶ÀýÇϴµ¥ ¿¬°üµÇ´Â À¯ÀüÇÐÀûÀÌ°í »ýÈÇÐÀûÀÎ ÇÁ·Î±×·¥À» Á¶»çÇÏ¸é¼ ÀÌ·ç¾îÁ³´Ù. °úÇÐÀÚµéÀº ÀϹÝÀûÀ¸·Î À¯ÀüÀÚÀÇ È°µ¿À» Á¶ÀýÇÏ´Â ½Ã½ºÅÛÀº ½ÇÇèÁã¿Í Àΰ£¿¡°Ô¼ À¯»çÇÏ°Ô ³ªÅ¸³ª¸ç ÁøÈÀÇ ½Ã°£°úÁ¤¿¡¼ º¸Á¸µÇ°Å³ª Áö¼ÓµÇ¾ú´Ù´Â »ç½ÇÀ» ¹ß°ßÇß´Ù.
À̹ø ¿¬±¸´Â À¯ÀüÀÚ Á¶Àý°ú ´Ù¸¥ ½Ã½ºÅÛÀº Æ÷À¯·ù »ý¹°Çп¡¼ ¸Å¿ì Áß¿äÇÏ´Ù´Â Á¡À» º¸¿©ÁÖ¾ú´Ù. À̵éÀº ¶ÇÇÑ ½ÇÇèÁã°¡ Àΰ£ »ý¹°ÇÐÀ̳ª Áúº´À» ¿¬±¸Çϴµ¥ ÀûÀýÇÑ ¸ðµ¨ÀÎÁö ÆÇ´ÜÇϰųª ÀϺΠ±× ÇѰ踦 ¼³¸íÇϱâ À§ÇÑ »õ·Î¿î Á¤º¸¸¦ Á¦°øÇß´Ù. ÃÖ±Ù ¿¬±¸´Â ±¹¸³º¸°Ç¿¬±¸¿øÀÇ ÀϺÎÀÎ ±¹¸³Àΰ£À¯Àüü¿¬±¸¼Ò (National Human Genome Research Institute, NHGRI)°¡ Áö¿øÇÏ´Â ÇÁ·Î±×·¥ÀÎ <DNA ¿ä¼Ò ¹é°ú»çÀü (ENCyclopedia OF DNA)> ¶Ç´Â ENCODE¶ó°í ºÒ¸®´Â ÇÁ·Î±×·¥ÀÇ ÀϺÎÀÎ »ýÁã ENCODE ÇÁ·ÎÁ§Æ®ÀÇ °á°úÀÌ´Ù. ENCODE´Â Àΰ£°ú »ýÁã À¯Àüü¿¡¼ ±â´ÉÀû ¿ä¼ÒÀÇ ±¤¹üÀ§ÇÑ Ä«Å»·Î±×¸¦ ¸¸µå´Â ÇÁ·ÎÁ§Æ®ÀÌ´Ù. ÀÌ·¯ÇÑ ¿ä¼ÒµéÀº ¾î¶² À¯ÀüÀÚÀÇ ±â´ÉÀ» ÄÑ°í ²ô´Â Á¶Àý±â´ÉÀ» °®´Â Á¶Àý¿ä¼Ò¿Í ´Ü¹éÁú, ºñ´Ü¹éÁú ºÎÈ£È (non-protein-coding)¿¡ °¡À̵å¶óÀÎÀ» Á¦°øÇÏ´Â À¯ÀüÀÚ¸¦ Æ÷ÇÔÇϰí ÀÖ´Ù.
NHGRIÀÇ µð·ºÅÍÀÎ ¿¡¸¯ ±×¸° (Eric Green)Àº ¡°»ýÁã´Â »ý¹°ÇÐÀû ¿¬±¸¸ðµ¨ÀÇ Áß½ÉÀ̾ú´Ù. ÀÌ·¯ÇÑ °á°ú´Â ¾î¶»°Ô »ýÁãÀ¯Àüü°¡ ÀÛµ¿ÇÏ´ÂÁö¿¡ ´ëÇÑ Ç³ºÎÇÑ Á¤º¸¸¦ Á¦°øÇÑ´Ù. ±×¸®°í °úÇÐÀÚµéÀÌ »ýÁã¿Í Àΰ£ÀÇ »ý¹°ÇÐÀ» ÀÌÇØÇϱâ À§ÇØ ¸¸µé ¼ö ÀÖ´Â ±Ùº» Åä´ë¿´´Ù. »ýÁã ENCODE µ¥ÀÌÅÍÀÇ Ä÷º¼ÇÀº ¿¬±¸°è¿¡ ¾öû³ª°Ô À¯¿ëÇÑ ÀÚ¿ø¡±À̶ó°í ¸»Çß´Ù. ÀÌ ÄÁ¼Ò½Ã¾öÀÇ <³×ÀÌó>¿¡ ¹ßÇ¥µÈ ¿¬±¸ÀÇ °øµ¿ÁÖÀúÀÚÀ̸ç ͏®Æ÷´Ï¾Æ ÁÖ¸³´ëÇÐ »÷µð¿¡°íÀÇ ¼¼Æ÷ºÐÀÚ»ý¹°ÇÐÀÚÀÎ ºù ·» (Bing Ren)Àº ¡°À̰ÍÀº óÀ½À¸·Î »ýÁã¿Í Àΰ£À» À¯Àüü ¼öÁØ¿¡¼ ü°èÀûÀ¸·Î ºñ±³ÇÑ ¿¬±¸ÀÌ´Ù. »ýÁã´Â ´ëºÎºÐ Àΰ£¿¡°Ô´Â ÈǸ¢ÇÑ ¸ðµ¨·Î ¾Ë·ÁÁ® ÀÖ´Ù. ¿ì¸®´Â ¸¹Àº °úÁ¤°ú °æ·Î°¡ »ýÁã¿¡¼ Àΰ£¿¡°Ô º¸Á¸µÇ¾ú´Ù´Â »ç½ÇÀ» ¹ß°ßÇß´Ù. ¿ì¸®´Â Àΰ£»ý¹°ÇÐÀ» ¹Ý¿µÇÏ´Â »ýÁã »ý¹°ÇÐÀÇ ¿©·¯ Ãø¸éÀ» ¿¬±¸ÇÔÀ¸·Î½á Àΰ£ Áúº´À» ¿¬±¸Çϴµ¥ µµ¿òÀ» Áش١±°í ¸»Çß´Ù.
¸¹Àº °æ¿ì¿¡ ¿¬±¸ÀÚµéÀº ÀϺΠDNA ¿°±â¼¿ÀÇ Â÷ÀÌ´Â »ýÁã À¯Àüü¿¡¼ »óÀÀÇÏ´Â Àΰ£Áúº´°ú ¿¬°áµÈ´Ù°í ¸»ÇÑ´Ù. À̵éÀº ¶ÇÇÑ Æ¯Á¤ À¯ÀüÀÚ¿Í ¿ä¼ÒµéÀº ÀÌ µÎ °¡Áö »ý¹°Á¾¿¡¼ À¯»çÇÏ°Ô ³ªÅ¸³ª¸ç Àΰ£Áúº´¿¡ ¿¬°üµÇ´Â °ÍÀ» ¿¬±¸ÇÒ ¼ö ÀÖ´Â »ýÁ㸦 ÀÌ¿ëÇÏ´Â ±â¹ÝÀ» Á¦°øÇÒ ¼ö ÀÖ´Ù°í ÁÖÀåÇß´Ù. ÇÏÁö¸¸ À̵éÀº ¶ÇÇÑ ¸¹Àº DNA º¯ÀÌ¿Í À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÆÐÅÏÀº °øÀ¯ÇÏÁö ¾Ê°í ÀÖÀ¸¸ç ÀáÀçÀûÀ¸·Î Áúº´¸ðµ¨·Î¼ »ýÁ㸦 »ç¿ëÇϴµ¥ ÀÖ¾î¼ ÇѰ踦 ¹ß°ßÇß´Ù. »ýÁã¿Í Àΰ£Àº À¯ÀüüÀÇ ¾à 1.5%¸¦ Â÷ÁöÇÏ´Â µ¿ÀÏÇÑ ´Ü¹éÁúÀ» ºÎÈ£ÈÇÏ´Â À¯ÀüÀÚ ¿°±â¼¿ÀÇ ¾à 70%¸¦ °øÀ¯Çϰí ÀÖ´Ù. ¿¹¸¦ µé¾î »ýÁã¸é¿ªÃ¼°è¿Í ½ÅÁø´ë»ç°úÁ¤°ú ½ºÆ®·¹½º ¹ÝÀÀ¿¡¼ ÀϺΠÀ¯ÀüÀÚ È°µ¿Àº Ãʱ⠿¬±¸¿¡¼ ¹ß°ßÇÑ °Íó·³ »ýÁã¿Í Àΰ£ »çÀÌ¿¡¼ ´Ù¾çÇÏ°Ô ³ªÅ¸³´Ù. ¿¬±¸ÀÚµéÀº »ýÁã À¯ÀüÀÚ¸¦ Á¶ÀýÇÏÁö¸¸ Àΰ£¿¡°Ô¼´Â ÀÌ¿¡ »óÀÀÇÏ´Â À¯ÀüÀÚ°¡ ¾ø´Â À¯ÀüÀÚ¿Í ´Ù¸¥ ¿ä¼ÒµéÀ» ã¾Æ³Â´Ù. »÷µð¿¡°íÀÇ ·¯µåÀ¨ ¾Ï¿¬±¸¼Ò (Ludwig Institute for Cancer Research)ÀÇ ÀÏ¿øÀ̱⵵ ÇÑ ·»Àº ¡°¿ì¸®´Â ÁøÈ°úÁ¤¿¡¼ ÀϺΠºÎºÐÀ» ¶¼¾î³»°í ´Ù¸¥ ºÎºÐÀ» ºÎ°¡ÇÑ Ã¥Ã³·³ »ýÁã À¯Àüü¸¦ Á¶»çÇß´Ù. À̰ÍÀº ¾Æ¸¶µµ ȯ°æ¿¡¼ »ýÁã¿Í À̰£ÀÌ ÀûÀÀÇÑ °á°úÀÏÁöµµ ¸ð¸¥´Ù¡±°í ¸»Çß´Ù.
½ºÅÄÆÛµå ´ëÇÐÀÇ À¯Àüü ¹× ¸ÂÃãÀÇÇм¾ÅÍ (Stanford Center for Genomics and Personalized Medicine)ÀÇ µð·ºÅÍÀ̸ç ÁÖÀúÀÚÀÎ ¸¶ÀÌŬ ½º³ªÀÌ´õ (Michael Snyder)´Â ¡°ÀϹÝÀûÀ¸·Î À¯ÀüÀÚ Á¶Àý±âÁ¦¿Í ³×Æ®¿öÅ©´Â »ýÁã¿Í Àΰ£¿¡°Ô¼ º¸Á¸µÇ¾ú´Ù. ÇÏÁö¸¸ ±× ¼¼ºÎÀûÀÎ °ÍÀº ´Ù¸£´Ù. ÀÌ·¯ÇÑ Â÷À̸¦ ÀÌÇØÇÔÀ¸·Î½á ¿ì¸®´Â ¾î¶»°Ô ±×¸®°í ¾ðÁ¦ »ýÁã¸ðµ¨ÀÌ Á¦ÀÏ Àß ÀÌ¿ëÇÒ ¼ö ÀÖ´ÂÁö¸¦ ÀÌÇØÇÒ ¼ö ÀÖ´Ù¡±°í ¸»Çß´Ù. <³×ÀÌó>¿¡ ¹ßÇ¥µÈ ³í¹®¿¡¼ ¿¬±¸ÀÚµéÀº »ýÁã¿Í Àΰ£Á¶Á÷ ¹× ¼¼Æ÷ÇüÅ¿¡¼ À¯ÀüÀÚ È°µ¿À» Á¶ÀýÇÏ´Â À¯ÀüÀÚ Àü»ç, Å©·Î¸¶Æ¾ Á¶ÀÛ ¹× ´Ù¸¥ °úÁ¤µéÀ» ºñ±³Çß´Ù. Àü»ç°úÁ¤Àº À¯ÀüÀÚÀÇ Á¤º¸¸¦ Àд °úÁ¤ÀÌ´Ù. Å©·Î¸¶Æ¾ (chromatin)Àº DNA¿¡ Á¢±ÙÇÒ ¼ö ÀÖµµ·Ï Á¶ÀýÇÔÀ¸·Î½á À¯Àüü ±â´ÉÀ» Á¶ÀýÇϴµ¥ µµ¿òÀ» ÁÖ´Â ´Ü¹éÁú ÆÐŰÁöÀÌ´Ù. ÀÌ·¯ÇÑ ÆÐŰÁöÀÇ º¯È´Â À¯ÀüÀÚ Á¶Àý¿¡ ¿µÇâÀ» ÁÙ ¼ö ÀÖ´Ù.
ÀÌ µÎ °¡Áö »ý¹°Á¾Àº À¯ÀüÀÚ È°µ¿À» Á¶ÀýÇϱâ À§Çؼ À¯»çÇÑ ÇÁ·Î±×·¥ÀÇ Çٽɱ׷ìÀ» °¡Áö°í ÀÖÁö¸¸ ¿¬±¸ÀÚµéÀº ƯÁ¤ÇÑ Á¶Á÷°ú ¼¼Æ÷ÇüÅ¿¡¼´Â Â÷À̰¡ ³ªÅ¸³´Ù´Â »ç½ÇÀ» ¹ß°ßÇß´Ù. <³×ÀÌó>Áö¿¡ ¹ßÇ¥µÈ ¿¬±¸¿Í ´Ù¸¥ °÷¿¡ ÃâÆÇµÈ ³í¹®ÀÇ °øµ¿ÁÖÀúÀÚÀÌ¸ç Ææ½Çº£´Ï¾Æ ÁÖ¸³´ëÇÐ À¯´Ï¹ö½ÃƼ ÆÄÅ© (Pennsylvania State University, University Park)ÀÇ ÇãÅ© ºñ±³À¯Àüü ¹× »ý¹°Á¤º¸¿¬±¸¼Ò (Huck Institute for Comparative Genomics and Bioinformatics)ÀÇ µð·ºÅÍÀÎ ·Î½º Çϵ𽼠(Ross Hardison)Àº ¡°»ýÁã¿Í Àΰ£ »çÀÌ¿¡ ¹ßÇö¼öÁØÀÌ Ã¼°èÀûÀ¸·Î Â÷À̰¡ ³ªÅ¸³ª´Â ¸¹Àº ¼öÀÇ À¯ÀüÀÚ°¡ Á¸ÀçÇÑ´Ù´Â °á°ú¸¦ ¾ò±â Àü±îÁö ¿ì¸®´Â ¸ð¸£°í ÀÖ¾ú´Ù. ÀÌÁ¦ ¿ì¸®´Â ¾î¶² À¯ÀüÀÚ°¡ »ýÁã¿Í Àΰ£ »çÀÌ¿¡ º¸Á¸µÈ ¹ßÇöÆÐÅÏÀÎÁö ¾Ë°Ô µÇ¾ú´Ù. ÀÌ·¯ÇÑ À¯ÀüÀÚ¸¦ »ç¿ëÇÏ´Â »ý¹°ÇÐÀûÀÎ °úÁ¤¿¡¼ »ýÁã´Â Àΰ£»ý¹°ÇÐÀÇ Ãø¸é¿¡¼ ÈǸ¢ÇÑ ¸ðµ¨¡±À̶ó°í ¸»Çß´Ù. Çϵð½¼Àº ±× ¹Ý´ëµµ ¶ÇÇÑ »ç½ÇÀ̶ó°í ¸»Çß´Ù: ¿¬±¸ÀÚµéÀº »ýÁ㸦 Àΰ£ÀÇ ¸ðµ¨·Î¼ »ý°¢ÇÒ ¶§ ÀÌµé »ý¹°Á¾ »çÀÌÀÇ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÆÐÅÏÀÇ Ã¼°èÀû Â÷À̸¦ ¼³¸íÇÒ Çʿ䰡 ÀÖ´Ù°í ÁöÀûÇß´Ù.
ÇöÀç »ýÁã¿Í Àΰ£ÀÇ Â÷À̸¦ ¾Ë¾Æ³»´Â ¿¬±¸¿¡ µÎ ±×·ìÀÌ Âü¿©Çϰí ÀÖ´Ù. <³×ÀÌó>Áö¿¡ °øµ¿ÀúÀÚÀÎ ½Ã¾ÖƲÀÇ ¿ö½ÌÅÏ ´ëÇÐÀÇ À¯Àüü°úÇÐ ¹× ÀÇÇÐ ±³¼öÀÎ Á¸ ½ºÅ¸¶Åä¾ß³ëÇ÷νº (John Stamatoyannopoulos)¿Í ±×ÀÇ µ¿·áµéÀº Àΰ£ÀÇ Á¶Á÷ÇüÅÂ¿Í 45°³ »ýÁã¼¼Æ÷¿¡¼ ±ÔÁ¦ DNA¸¦ ã¾Æ³»´Â µð³ªÁ¦ 1 °ú¹ÎÁöÁ¡ (DNase 1 hypersensitivity site)À̶ó ºÒ¸®´Â 130¸¸°³ ÀÌ»óÀÇ À¯Àüü ÁöÁ¡À» ºñ±³Çß´Ù. À̵éÀº <»çÀ̾ð½º>Áö¿¡ ¹ßÇ¥ÇÑ ³í¹®¿¡¼ ÀÌµé ¿ä¼Òµé Áß¿¡¼ 35%°¡ »ýÁã¿Í Àΰ£¿¡°Ô¼ °øÅëÀûÀ¸·Î °øÀ¯µÇ°í ÀÖÀ¸¸ç ´Ù¸¥ ¼¼Æ÷¿¡¼ Ȱ¼ºÈµÈ´Ù. ±×´Â ¡°¿ì¸®´Â °øÀ¯µÇ°í ÀÖ´Â Á¶Àý¿°±â¼¿ ³»ºÎ¸¦ Á¶»çÇßÀ¸¸ç »ýÁã¿Í Àΰ£ À¯Àüü´Â Á¶Àý¿¡ ÀÖ¾î¼ °øÅëÀûÀÎ ¾ð¾î¸¦ »ç¿ëÇÑ´Ù´Â °ÍÀ» ¾Ë¾Æ³Â´Ù. ÇÏÁö¸¸ ÁøÈ°úÁ¤¿¡´Â ¾öû³ À¯¿¬¼ºÀÌ Á¸ÀçÇÑ´Ù. ¿¹¸¦ µé¾î »ýÁãÀÇ °£¿¡¼ Ȱ¼ºÈµÈ ¿ä¼ÒµéÀº Àΰ£ÀÇ ³ú¿¡¼ Ȱ¼ºÈµÇµµ·Ï Àç¸ñÀûȵȴÙ. ÀÌ·¯ÇÑ Àç¸ñÀûÈ (repurposing)´Â ÀÚ¿¬ÀÌ Á¶ÀýÅëÁ¦¸¦ ¼ºÃëÇϴµ¥ »ç¿ëµÉ ¼ö ÀÖ´Â ¾öû³ª°Ô ¼Õ½¬¿î º¯È¸¦ º¸¿©Áش١±°í ¸»Çß´Ù.
<Proceedings of the National Academy of Sciences>¿¡ ¹ßÇ¥µÈ ³í¹®¿¡¼ ½º³ªÀÌ´õÀÇ ¿¬±¸ÆÀÀº »ýÁã¿Í Àΰ£¿¡¼ 15°¡Áö ´Ù¸¥ Á¶Á÷ÇüÅÂÀÇ À¯ÀüÀÚ ¹ßÇöÀ» ºñ±³Çß´Ù. ÀÌÀü ¿¬±¸°á°ú¿Í ºñ±³Çϸé À̵éÀº ÀϺΠÀ¯ÀüÀÚ ÆÇµ¶Àº ÀÌ µÎ °¡Áö »ý¹°Á¾¿¡¼ µ¿ÀÏÇÑ Á¶Á÷ »çÀÌ¿¡¼ º¸´Ù µ¿ÀÏÇÑ »ý¹°Á¾¿¡¼ ´Ù¸¥ Á¶Á÷µé »çÀÌ¿¡¼ Á» ´õ À¯»ç¼ºÀÌ ³ªÅ¸³´Ù´Â »ç½ÇÀ» ¹ß°ßÇß´Ù. ENCODE µ¥ÀÌÅÍ´Â »ýÀÇÇа迡¼ ÀÚÀ¯·Ó°Ô °øÀ¯µÇ¸ç ¿¬±¸¿¡ »ç¿ëµÈ »ýÁãÀÚ¿øµéÀº Áö±Ý±îÁö 50¿© °¡Áö ³í¹®¿¡¼ »ç¿ëµÇ¾ú´Ù.
Ãâó: <ScienceDaily> 2014³â 11¿ù 19ÀÏ
¿ø¹®ÂüÁ¶:
Yong Cheng, Zhihai Ma, Bong-Hyun Kim, Weisheng Wu, Philip Cayting, Alan P. Boyle, Vasavi Sundaram, Xiaoyun Xing, Nergiz Dogan, Jingjing Li, Ghia Euskirchen, Shin Lin, Yiing Lin, Axel Visel, Trupti Kawli, Xinqiong Yang, Dorrelyn Patacsil, Cheryl A. Keller, Belinda Giardine, The Mouse ENCODE Consortium, Anshul Kundaje, Ting Wang, Len A. Pennacchio, Zhiping Weng, Ross C. Hardison, Michael P. Snyder. Principles of regulatory information conservation between mouse and human. Nature, 2014; 515 (7527): 371 DOI: 10.1038/nature13985
Feng Yue et al. A comparative encyclopedia of DNA elements in the mouse genome. Nature, 2014; 515 (7527): 355 DOI: 10.1038/nature13992
Andrew B. Stergachis, Shane Neph, Richard Sandstrom, Eric Haugen, Alex P. Reynolds, Miaohua Zhang, Rachel Byron, Theresa Canfield, Sandra Stelhing-Sun, Kristen Lee, Robert E. Thurman, Shinny Vong, Daniel Bates, Fidencio Neri, Morgan Diegel, Erika Giste, Douglas Dunn, Jeff Vierstra, R. Scott Hansen, Audra K. Johnson, Peter J. Sabo, Matthew S. Wilken, Thomas A. Reh, Piper M. Treuting, Rajinder Kaul, Mark Groudine, M. A. Bender, Elhanan Borenstein, John A. Stamatoyannopoulos. Conservation of trans-acting circuitry during mammalian regulatory evolution. Nature, 2014; 515 (7527): 365 DOI: 10.1038/nature13972
Benjamin D. Pope, Tyrone Ryba, Vishnu Dileep, Feng Yue, Weisheng Wu, Olgert Denas, Daniel L. Vera, Yanli Wang, R. Scott Hansen, Theresa K. Canfield, Robert E. Thurman, Yong Cheng, Gunhan Gulsoy, Jonathan H. Dennis, Michael P. Snyder, John A. Stamatoyannopoulos, James Taylor, Ross C. Hardison, Tamer Kahveci, Bing Ren, David M. Gilbert. Topologically associating domains are stable units of replication-timing regulation. Nature, 2014; 515 (7527): 402 DOI: 10.1038/nature13986
http://www.sciencedaily.com/releases/2014/11/141119132703.htm
|
|